2025 : Meilleur logiciel comptabilité pour professionnel de santé

1. La compta vous donne des sueurs froides ? 😥 Voici la solution !
2. Les 4 critères clés pour choisir votre logiciel de compta (et ne pas vous tromper)
3. Résumé du classement : le podium de 2025 🏆
4. N°1 : Pennylane, le couteau suisse ultra complet
5. N°2 : Indy, la simplicité redoutable pour les indépendants
6. N°3 : Dougs, l’expert-comptable en ligne qui vous accompagne
7. Les autres options à considérer : Abby, EBP, Macompta.fr et Sage
8. L’angle mort : et l’intégration avec votre logiciel métier (Doctolib, etc.) ?
9. Alors, après ce tour d’horizon, quel logiciel choisir ?

La compta vous donne des sueurs froides ?  Voici la solution !

Vous en avez marre de perdre 3 heures par semaine à trier vos relevés bancaires ? 😩 La déclaration 2035 vous donne des cauchemars ? Vous n’êtes pas seul ! En 2025, 49 % des indépendants déclarent stresser face à l’administratif. Mais imaginez un outil qui synchroniserait vos comptes en 1 clic, catégoriserait vos cotisations URSSAF/CARPIMKO sans que vous leviez le petit doigt, et vous guiderait pas à pas pour la DS-PAMC… 🤯

Votre temps a une valeur. Combien de patients pourriez-vous voir de plus chaque mois si vous gagniez 4h par semaine ? Avec la bonne solution, on passe de 8h à 2h de compta par mois en moyenne. Et cerise sur le gâteau : les meilleurs logiciels collaborent avec vos AGA pour éviter les mauvaises surprises lors du dépôt des dossiers.

Dans ce comparatif ultra-spécialisé pour médecins, kinés, infirmiers et orthoptistes, je vais vous révéler les 7 logiciels qui transforment la corvée comptable en jeu d’enfant. On passera en revue leurs forces sur les points qui vous importent vraiment : gestion des frais de déplacement (IK), suivi précis des charges sociales, et surtout… cette synchronisation bancaire qui vous libère l’esprit 🙌

Et pour les nouveaux installés, réussir son installation en libéral commence par le bon choix d’outil. Prêt à faire disparaître vos migraines administratives ? Plongeons dans le vif du sujet !

Les 4 critères clés pour choisir votre logiciel de compta (et ne pas vous tromper)

En tant que praticien débordé, vous ne voulez pas gaspiller 5h/semaine dans des tâches administratives alors que votre priorité est vos patients. Gardez en tête que tous les logiciels ne maîtrisent pas les subtilités des métiers de santé.

1. Un logiciel pensé pour le régime BNC et la déclaration 2035

Le régime BNC encadre 90% des praticiens libéraux 🩺. Votre outil doit générer automatiquement la déclaration 2035 (et son annexe DS-PAMC) et produire le FEC obligatoire en cas de contrôle. Priorisez les logiciels permettant des ajustements rapides en cas d’erreur.

2. L’automatisation : votre meilleure alliée pour gagner du temps

La synchronisation bancaire 🔄 est LE critère non négociable. Des outils comme Pennylane ou Indy récupèrent vos transactions et catégorisent automatiquement vos cotisations URSSAF ou CARPIMKO. Exemple concret : gérer vos cotisations sociales prendra 1 minute au lieu de 15 grâce à l’IA qui détecte les écarts.

3. La gestion de vos frais professionnels spécifiques

Combien de kilomètres parcourez-vous pour vos visites à domicile ? 🚗 Un logiciel pertinent calcule automatiquement vos indemnités kilométriques (IK) selon les barèmes 2024. Oubliez les oublis de justificatifs : les bons outils évitent de perdre 20% de vos frais déductibles en automatisant la numérisation (certains intègrent un lecteur OCR).

4. Un support client qui comprend votre métier

Un appel à 19h après une journée de consultation ? 📞 Des logiciels comme Swapn ou Evoliz forment leurs équipes aux spécificités médicales. Vous éviterez les malentendus sur les règles de déduction ou les plafonds de frais. Le support doit guider sans jargon comptable, surtout pour les exports AGA.

• ✅ Compatibilité BNC et préparation de la déclaration 2035.
• ✅ Synchronisation bancaire automatique et fiable.
• ✅ Aide à la gestion des frais spécifiques (IK, cotisations sociales, etc.).
• ✅ Facilité de collaboration avec votre AGA.
• ✅ Un support client spécialisé et réactif.

Résumé du classement : le podium de 2025 🏆

En 2025, Pennylane et Indy s’imposent pour les pros de santé débordés. Pennylane, avec sa synchronisation bancaire ultra-rapide et sa collaboration simplifiée avec les AGA, offre une solution premium et complète. Indy, à partir de 12 €/mois, se démarque par sa simplicité et son automatisation (catégorisation URSSAF, déclarations fiscales en 1 clic).

Leur point commun ? Gain de temps, fiabilité et interface intuitive. Pennylane convient aux structures en croissance, Indy aux débuts ou activités légères. Envie de tout savoir ? Découvrez le comparatif complet pour bien choisir ! 💡

Comparatif pros santé 🩺 : synchronisation bancaire évite erreurs, support CARPIMKO <24h .

N°1 : Pennylane, le couteau suisse ultra complet

Pour qui ?

Pennylane s’adresse aux professionnels de santé en libéral (médecins, kinés, infirmiers, orthoptistes, etc.) cherchant un outil tout-en-un pour gérer comptabilité, facturation et trésorerie 🎯. Idéal pour les praticiens en croissance ou ceux envisagent un passage en société, l’outil centralise toutes les fonctions pour simplifier l’administratif. Un kiné ou infirmier·ière souhaitant automatiser ses notes de frais y trouvera son compte sans se perdre dans des processus complexes.

Les avantages de Pennylane

La synchronisation bancaire fluide est un vrai gain de temps 🕒 : plus de saisie manuelle, les mouvements s’importent automatiquement. La collaboration avec votre AGA est simplifiée via un partage en temps réel, éliminant les relances épuisantes. Si vous évoluez (passage en IS, embauche), Pennylane s’adapte. La catégorisation des cotisations URSSAF/CARPIMKO, gestion des frais de déplacement (IK) et préparation DS-PAMC se font en un clic, avec des tableaux de bord clairs et des rappels automatiques pour ne rien oublier.

Les points de vigilance

Ses fonctionnalités riches peuvent sembler excessives pour une 2035 basique. Le plan Basique (14€/mois) est abordable, mais les options (comptabilité avancée, paie) alourdissent la facture. L’offre Premium (79€/mois) convient aux structures établies. Pour les débutants, Pennylane propose un support client réactif avec guides en ligne et webinaires pour une prise en main sereine.

Les tarifs

Formules disponibles :

• Basique : 14€/mois – facturation, suivi des dépenses, compte pro.
• Essentiel : 24€/mois – ajoute analyses financières, relances automatisées.
• Premium + Module comptable : 79€/mois – déclarations fiscales EDI, comptabilité complète.

Un essai gratuit de 15 jours permet de tester l’outil. Avec une note de 4,6/5 sur 809 avis, sa fiabilité est avérée. Pour un an, le plan Basique coûte 168€, un budget raisonnable pour automatiser les tâches chronophages et éviter les erreurs dans les déclarations.

N°2 : Indy, la simplicité redoutable pour les indépendants

Pour qui ?

Indy s’adresse aux praticiens en BNC solo, débordés par l’administratif. 🩺 Si tu veux faire ta déclaration 2035 sans stress, tout en économisant temps et budget, ce logiciel est fait pour toi. Fini les tracas liés aux cotisations sociales ou aux erreurs de télétransmission !

Les avantages d’Indy

Indy brille par sa prise en main ultra-simple et son interface fluide. 💡 Tu gagnes du temps grâce à la synchronisation bancaire automatique et à la catégorisation intelligente des dépenses. Plus besoin de noircir des tableaux Excel : tout est regroupé en un clic !

Autre atout : son rapport qualité-prix imbattable. Pour 12€/mois, tu as accès à la gestion complète de ta compta, y compris la télétransmission à ton AGA. Et cerise sur le gâteau ? Plus de 7 800 avis sur Trustpilot le valident !

• 🤖 Synchronisation bancaire et catégorisation automatique des transactions.
• 📝 Pré-remplissage de la déclaration 2035 et télétransmission à l’AGA.
• 📊 Suivi en temps réel de votre résultat et de vos cotisations sociales.
• 💬 Un service client par chat très réactif et apprécié des utilisateurs.

Les points de vigilance

Indy n’est pas l’idéal si ton activité prévoit de passer en société prochainement. Pour des structures complexes ou des besoins ultra-spécifiques (comme la gestion de plusieurs entités), Pennylane ou Sage pourraient être plus adaptés. Mais si tu restes en BNC, Indy est un allié précieux !

Les tarifs

Indy démarre à 12€/mois (soit 144€/an), demandes l’essai gratuit de 30 jours. Tu as droit à une offre « Essentiel » gratuite, mais elle manque de certaines fonctions essentielles pour les déclarations 2035. L’offre payante inclut tout, sans frais cachés. Parfait pour les praticiens qui veulent dormir sur leurs deux oreilles !

N°3 : Dougs, l’expert-comptable en ligne qui vous accompagne

Parfois, mieux vaut ne pas jouer les autodidactes quand on veut éviter les erreurs. 💼 Dougs s’adresse aux praticiens souhaitant dormir sur leurs deux oreilles grâce à un accompagnement d’expert-comptable certifié. Spécialiste des BNC, il simplifie la déclaration DS-PAMC et le suivi des cotisations sociales.

Pour qui ?

Pour les libéraux qui considèrent que leur temps vaut de l’or. 🕒 Plutôt que de jongler avec les déclarations sociales, déléguer à des pros qui maîtrisent les spécificités des professions médicales. Idéal pour les professionnels de santé débordés par l’administratif.

Les avantages de Dougs

• Expert-comptable certifié disponible 5j/7
• Application mobile intuitive pour gérer sa compta en déplacement
• Solution BNC/IS avec suivi des cotisations sociales
• Support client ultra-réactif (réponse en 24h max)
• Gestion des frais kilométriques (IK) et déclaration DS-PAMC simplifiée

Les points de vigilance

Attention : le prix est plus élevé qu’un logiciel 100% autonome. 🚨 Moins flexible que Pennylane ou Indy si vous aimez tout contrôler vous-même.

Les tarifs

Les offres démarrent à 49€ HT/mois pour les BNC simples. 💰 Pour les sujets complexes (TVA, gestion de société), prévoyez 79€ HT/mois minimum. Ce tarif inclut la catégorisation des charges sociales et le support spécialisé.

N’hésitez pas à demander un devis via notre lien partenaire pour comparer avec votre situation actuelle. Un expert analysera vos besoins spécifiques (cotisations sociales, gestion des frais kilométriques, etc.).

Les autres options à considérer : Abby, EBP, Macompta.fr et Sage

Zoom sur des logiciels alternatifs, adaptés à des besoins précis. 🧐

Abby : l’alternative moderne pour les micro-entrepreneurs

Abby séduit par son interface fluide et son tarif accessible (offre gratuite). 🎯 Gestion des bases : facturation, URSSAF, cotisations sociales. Son support est souvent lent (jusqu’à 2 jours) et des bugs (erreurs de RIB) ont été signalés. À tester gratuitement si vous débutez en libéral. 🤔

EBP et Sage : les classiques pour besoins complexes

Pour les professionnels exigeant une gestion poussée. 📊 EBP propose des modules pour les professions médicales (rétrocessions, suivi CARPA) et facilite le transfert vers une AGA. Sage inclut des outils analytiques, à partir de 228€/an. Adaptés aux cabinets structurés, mais peu pratiques pour un praticien solo. 🤷‍♂️

Macompta.fr : l’économique à petit prix

À 6,67€ HT/mois, c’est l’option la plus abordable. Pour enregistrer recettes/dépenses. La liasse fiscale (2035) est payante, l’automatisation limitée. Il offre un export FEC et un service EDI pour transmettre la liasse. Idéal pour un budget serré, mais prévoyez du temps pour les tâches manuelles.

Le choix dépend de votre besoin d’automatisation, budget et collaboration avec une AGA. Abby et Macompta.fr s’adaptent aux petites structures, EBP et Sage aux cabinets étoffés. Priorisez selon vos spécificités !

L’angle mort : et l’intégration avec votre logiciel métier (Doctolib, etc.) ?

Voici un détail souvent sous-estimé : votre logiciel de gestion de patientèle (type Doctolib, Weda ou Orisha) génère des recettes, mais comment les intégrer dans votre compta sans tout ressaisir manuellement ? 🤔

Pas de magie là-dedans : la plupart de ces outils permettent un export CSV des recettes (factures émises, paiements reçus). Le hic ? Ce fichier doit être importable dans votre logiciel comptable pour éviter la double saisie. Un critère crucial à vérifier avant de choisir votre solution.

Voici pourquoi cette intégration fait toute la différence :

• ⏱️ Un gain de temps considérable chaque mois
• 📉 Une réduction drastique du risque d’erreurs et d’oublis
• 🧘‍♀️ Une charge mentale en moins : plus besoin de pointer manuellement chaque paiement
• 👀 Une vision claire et unifiée de votre activité, de l’acte médical à la déclaration fiscale

Concrètement, prenez exemple sur Doctolib : ses versions payantes permettent d’exporter vos factures en CSV (via les outils comme Doctolib). Il suffit d’un clic pour générer ce fichier, que votre logiciel comptable doit intégrer automatiquement. C’est d’ailleurs un critère à vérifier absolument avant de vous engager.

Autre enseignement clé : Weda, bien qu’excellent pour la gestion de patientèle, n’a pas de module comptable intégré. Il faut donc passer par un partenaire comme Selfmed pour gérer les flux financiers. Gardez en tête que l’idéal est un logiciel qui simplifie ces échanges de données sans paramétrage technique compliqué. Pas besoin d’être un expert en informatique pour automatiser sa compta, non ?

Alors, après ce tour d’horizon, quel logiciel choisir ?

Pour les pros de santé en BNC, Indy ⚡️ est le meilleur choix pour une comptabilité simplifiée. Sa synchronisation bancaire rapide et sa catégorisation automatique des dépenses optimisent le suivi des cotisations URSSAF ou CARPIMKO sans prise de tête.

Préférez Pennylane 🚀 si vous voulez une solution complète, évolutive et compatible avec votre AGA. En plus de la comptabilité, il gère la facturation, les relances clients et offre un tableau de bord détaillé pour piloter votre trésorerie.

Conseil malin ? Testez les essais gratuits ! Vérifiez l’interface, la synchronisation bancaire, et le confort d’utilisation. Vous dormirez sur vos deux oreilles 😴, sans erreur dans vos déclarations sociales.

Pour aller plus loin, consultez notre guide détaillé pour adapter votre outil à votre métier.

Tableau comparatif des fonctionnalités

Logiciel	Gestion des frais de véhicule (IK)	Aide à la déclaration DS-PAMC	Catégorisation automatique des cotisations (URSSAF, CARPIMKO…)	Support client spécialisé
Pennylane	✅	✅	✅	✅
Indy	✅	✅	✅	✅
Dougs	✅	❌	✅	✅
Abby	❌	❌	✅	✅
EBP	❌	❌	❌	✅
Macompta.fr	❌	❌	❌	✅
Sage	❌	❌	❌	❌

Objectif : vous libérer du temps pour vos patients 💚. Avec ces outils, oubliez les nuits blanches liées à vos déclarations !

Prêt à faire votre choix ?

Indy, Pennylane, Dougs l’option sécurisée avec expert à portée de main. Votre temps est trop précieux pour la paperasse : testez leurs essais gratuits, et libérez des heures pour votre cœur de métier ! 💡